В 2005 году жизнь свела ее с актером Ливом Шрайбером. Звездная пара вскоре стала жить вместе в гражданском браке. Через 2 года Наоми родила первенца Александра Пита, а в конце 2008 года на свет появился второй сын Семюэль Кай. На сегодняшний день семья проживает в Нью-Йорке, но Наоми с Ливом пока не собираются оформлять отношения официально.
Наоми Уоттс исполнит главную роль в экранизации книги Брэдли Тревора Грива «Пингвин
Блум» (Penguin Bloom) — реальной истории про то, как одна маленькая птичка
спасла семью. Проект продюсирует Риз Уизерспун.
